动荡爆发之后，全党、全军掀起了一波「阶级斗争」的狂潮，激进分子们打着「闹革命」的旗号、为非作歹，大肆残害老同志，光是在1966年下旬，便有数百位军政干部被打倒，时任空军司令的吴法宪便是其中之一。
吴法宪算是一位比较正派的革命者，他早年曾在中央苏区浴血奋战、立功无数，抗战时，他又在山东战场大显神威，数次挫败日伪军和国民党军。解放战争时，他在东野任职，是林彪的得力干将。建国后，他长期在空军部队工作，与刘亚楼将军一起建设了一支强有力的空中力量，保卫我国的领空安全。
可就是这么一位战功卓著的老将，居然在动荡时期被居心叵测者扣上了「右派」的帽子，继而遭到批斗和关押。后来，林彪向他伸出了援助之手，帮他虎口脱险、官复原职。如此大恩，吴法宪怎能不感激？自此之后，他誓死追随林彪，成了林的「铁杆」同党。
林原本也是一位好同志，但在动荡时期，他受「左倾」思想的影响，心态慢慢发生了变化，开始搞政治斗争、争权夺利，迫害革命战友，犯了不少错误。吴法宪跟着林，难免也会做一些不合时宜的事情，在1967年，他参与发起了针对少奇同志、邓公和陶铸同志的政治风暴，致使这三位同志被革职，其中刘、陶更是先后被迫害致死，实在令人惋惜。
时间来到1970年，党中央按照预定计划在庐山召开了党代会，会上林彪和康生突然提出要恢复「国家主席」一职，吴法宪和黄永胜等人立即予以附和。明眼人都能看出来，这是一场彻头彻尾的「政治阴谋」，毛主席对此很是反感，于是便点名批评了以林为首的一批人。会后，康生直接被革职关押，吴法宪见状大惊失色，他很担心自己也会落得康生一样的下场，因此惶惶不可终日，整个人一直处于紧绷状态。
时间来到1971年下旬，林的儿子胆大包天，居然想要暗害毛主席，好在主席比较机敏，提前察觉到了危险，一举粉碎了罗织的阴谋，化险为夷。不久之后，震惊中外的九一三事件爆发，林彪以及叶群等人坠亡。虽然中央对此事严格保密，但吴法宪还是通过特殊渠道了解到了这一噩耗。
直觉告诉他，中央一定会将此事调查到底，届时他必定会遭到「清算」。果不其然，在一周之后，毛主席授意中央警卫团逮捕了吴法宪，将其关入秦城监狱。吴法宪在狱中认真反思了自己的错误，并数次给党中央写信忏悔自己的罪行，希望取得谅解。
1981年，他接受了最高法的审判，被判处十七年有期徒刑，在庭审现场，他痛哭流涕，直言自己对不起党组织和人民，自己认罪认罚，绝不上诉。同年8月，党中央在经过认真考虑之后，决定特批吴保外就医，并允许他选择一个城市作为终老之所。吴法宪在经过仔细挑选后，决定在济南安度余生。
晚年的吴法宪早已没了曾经的锐气和傲气，他如同普通人一样生活，每天到菜市场买便宜菜，闲暇时会到街头和同龄人喝喝茶，下下象棋，日子过得倒也安逸。邻居们知道吴法宪是老红军，因此对他很是尊重，每次碰到他都会热情打招呼，逢年过节还会给他送一些瓜果蔬菜。而吴法宪为了报答邻居们，便义务为邻居家的小孩子补课，教孩子们数学、语文以及基础的俄语。有一次，一家香港媒体找到吴法宪，想要对他做一个专访，吴法宪当即选择「装聋作哑」予以拒绝，过去的事就让它烟消云散，自己不想再提及。
上个世纪末，山东省委特地给吴法宪安排了一处比较宽敞的小院居住，吴法宪为此很是高兴，他一再给山东省委写信表示感谢，省委则回信称这是对老同志应有的照顾。不过吴法宪还没过几天幸福日子，他便被查出患上了严重的老年病，必须住院治疗。于是吴法宪便写信给党中央求助，党中央随即将他安排到济南军区总医院接受治疗，并允许他享受免费医疗待遇。
时间来到2004年，吴法宪病逝，时年八十九岁。家人们为了避免节外生枝，并没有大张旗鼓的举办葬礼，可仍有上千人自发前来为这位老红军送行，追悼会后吴法宪的骨灰被迁往一处偏僻的革命陵园安葬。
